25일 열린 건교부와 철도노조와의 협의는 건교부의 무대책을 확인하는 것으로 끝났다. 이날 건교부는 차관과 구본환 철도구조개혁과장 만이 참석했다.
철도노조는 위원장, 수석 부위원장, 정책실장, 교육국장, 정책국장 등 5인이 참석했다.

건교부 차관은 4.20합의에 의해 노조 등 이해 당사자와 충분히 협의를 거쳤다며 10여 차례 이해 당사자와 협의했다고 주장했다. 그러나 이 중 노조와 5차례 이상 협의했다고 주장한 근거로 제출한 사례가 공청회를 한다고 공문을 발송했다거나 철도청과 철도노조 사이의 일상적 협의를 모두 포함하는 것이었다. 철도노조는 구조개혁의 내용에 관해서 협의한 것이 있다면 구체적인 참석자와 내용을 밝힐 것을 요구했으나 건교부 측은 이에 응하지 않았다.

한편 철도노조는 현재 사태의 해결방안에 관한 안이 있으면 제출하라고 요구했으나 건교부는 아무런 안도 제출하지 않았다. 결국 6월 28일 파업을 코앞에 두고도 건교부는 국민의 따가운 시선을 피하기 위한 요식행위만을 되풀이하고 있는 것이다.
천환규 철도노조 위원장은 6월 입법 중단이라는 노조의 요구에 마치 철도개혁 자체를 막으려는 것으로 오해하고 있는데, 지금이라도 입법을 중단한다면 12월 안에 철도개혁 입법을 마무리 할 수 있도록 합의할 수 있다며 정부의 대책 마련을 촉구했다.